Naruto là con trai của Hokage Đệ Tứ Namikaze Minato (Tia chớp Vàng Làng Lá) và Uzumaki Kushina. Lúc Naruto mới sinh ra cũng là lúc mà Kurama (Cửu Vĩ) bị thả ra và phá hoại làng, cha của Naruto lúc đó là Hokage Đệ Tứ đã hi sinh thân mình phóng ấn nó lại vào người Naruto để cứu làng, biến cậu thành Jinchuuriki (Vật Chủ) của Cửu Vĩ, mẹ cậu vốn là Jinchuuriki trước đó cũng bị mất do Cửu Vĩ bị lôi ra khỏi người. Sau khi Đệ Tứ mất, Hokage Đệ Tam Sarutobi Hiruzen quay trở lại điều hành Làng Lá, ông đã lấy họ mẹ đặt cho Naruto để che đậy và không hề tiết lộ thân phận của cậu. Tuy nhiên ông vẫn âm thầm quan tâm đến Naruto.
Naruto có một tuổi thơ cô độc, không biết cha mẹ là ai, không có nổi một người bạn và luôn bị mọi người trong làng nhìn với ánh mắt lạnh lùng (bởi vì họ sợ rằng Jinchuuriki có thể gây nguy hiểm cho họ). Bởi thế, Naruto đã luôn có gắng gây sự chú ý bằng những trò quậy phá. Người đầu tiên công nhận sự tồn tại của cậu là thầy giáo đầu tiên của cậu, thầy Umino Iruka. Trong Học viện Ninja, cậu thích một cô bé tên là Haruno Sakura, nhưng cô bé đó lại chết mê chết mệt anh chàng đẹp trai Uchiha Sasuke, người được coi là thiên tài trong lớp học và cũng là người mà Naruto cực kỳ ghét và luôn muốn vượt qua.
Trong lớp học có một cô bé thầm thích Naruto là Hyuga Hinata nhưng cô bé đó rất nhút nhát, không dám nói ra. Naruto phải nói là một học sinh có học lực rất tệ, trong kỳ thi tốt nghiệp học viện ninja cậu đã thi trượt ba lần, tên thầy Mizuki đã lợi dụng cậu đi ăn cắp cuốn bí kíp cấm thuật của Hokage. Trong trận chiến với Mizuki để bảo về Naruto, Iruka đã lấy thân mình đỡ đòn bảo vệ cho Naruto. Từ đó, đối với Naruto, Iruka còn hơn cả một người thầy. Cậu đã học được cấm thuật Đa trọng ảnh phân thân mà sau này có thể coi đó là thuật làm nên thương hiệu Naruto. Iruka đã cho cậu đậu qua kỳ thi tốt nghiệp và trao cho băng trán biểu tượng của Làng Lá.
Sau đó cậu được phân vào Đội 7 cùng với Haruno Sakura và Uchiha Sasuke dưới sự dẫn dắt của ninja thượng đẳng (Jounin) Hatake Kakashi. Bốn người họ đã dần nảy sinh những tình cảm đặc biệt như một gia đình. Đặc biệt giữa Naruto và Sasuke, hai người đã ngầm coi nhau như bạn thân và họ không ngừng cố gắng tập luyện để vươn lên. Tuy nhiên trong lòng Sasuke luôn ấp ủ ý định một ngày nào đó sẽ giết chết anh trai của mình là Uchiha Itachi, người đã sát hại cả gia tộc Uchiha và bỏ Làng Lá theo tổ chức tội phạm Akatsuki. Orochimaru (một trong Tam Nin (Sannin) huyền thoại của Làng Lá nhưng cũng là kẻ phản bội làng) đã lợi dụng điều này để dụ dỗ Sasuke đi theo hắn, nhằm mục đích chiếm lấy thể xác của Sasuke. Mặc dù đã rất cố gắng nhưng Naruto đã thất bại trong việc đuổi theo và bắt Sasuke về. Từ đó cậu coi việc đưa được Sasuke trở về làng là mục tiêu quan trọng hàng đầu.
Trong những năm tiếp theo, Naruto đã đi theo tiên nhân Jiraiya (cùng là đệ tử của Hokage Đệ Tam và là một trong Tam Nin huyền thoại của Láng Lá) học thuật trong vòng 3 năm. Sau đó, thầy Kakashi dạy thêm cho cậu những nhẫn thuật cao cấp khác. Qua những trận chiến đã tôi luyện một Naruto trưởng thành hơn. Ý chí và nỗ lực của Naruto đã giúp những người khác thay đổi cách suy nghĩ rất nhiều (Hinata, Gaara, Tsunade, Bà Chiyo, Pain, hay Uchiha Obito).
Sau khi Uchiha Madara hồi sinh và tuyên chiến Đại chiến thế giới ninja lần thứ tư nhằm mục đích thu nhập các Vĩ Thú để thực hiện kế hoạch Nguyệt Nhãn của hắn, Naruto đã được Jinchuuriki của Bát Vĩ là Killer B ở Làng Mây chỉ cho cách điều khiển sức mạnh của Cửu Vĩ. Đến lúc này có thể nói Naruto là ninja mạnh nhất trong giới ninja đương thời. Cậu cùng với Sasuke phối hợp tiêu diệt được Madara và Thập Vĩ (kết hợp của cả chín Vĩ Thú), cũng như tiêu diệt được nữ thần Otsutsuki Kaguya. Sau đó Naruto và Sasuke đã có một trận chiến bất phân thắng bại và bắt tay làm hòa. Sau này cậu trở thành Hokage Đệ Thất, kết hôn với Hinata, có một con trai (Uzumaki Boruto) và một con gái (Uzumaki Himawari). Sarada – con gái của Sasuke và Sakura lấy anh làm hình tượng mẫu mực và ước mơ muốn trở thành Hokage.
